Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRGAP2CP0DJJ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms