Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms