Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VIL1P09327 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VIL1P09327 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIL1P09327 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VIL1P09327 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VIL1P09327 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VIL1P09327 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms