Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GJB1P08034 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB1P08034 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GJB1P08034 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GJB1P08034 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GJB1P08034 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms