Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POMCP01189 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POMCP01189 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POMCP01189 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POMCP01189 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POMCP01189 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POMCP01189 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POMCP01189 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POMCP01189 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POMCP01189 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POMCP01189 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POMCP01189 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POMCP01189 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POMCP01189 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms