Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
F9P00740 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
F9P00740 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
F9P00740 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
F9P00740 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
F9P00740 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
F9P00740 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
F9P00740 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
F9P00740 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F9P00740 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F9P00740 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
F9P00740 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F9P00740 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
F9P00740 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms