Protein–RNA interactions for Protein: O95196

CSPG5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5O95196 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSPG5O95196 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSPG5O95196 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms