Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRIG2O94898 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LRIG2O94898 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms