Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UFL1O94874 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UFL1O94874 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UFL1O94874 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
UFL1O94874 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFL1O94874 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFL1O94874 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFL1O94874 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFL1O94874 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UFL1O94874 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms