Protein–RNA interactions for Protein: O94822

LTN1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, humanhuman

Predictions only

Length 1,766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTN1O94822 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LTN1O94822 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LTN1O94822 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTN1O94822 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTN1O94822 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTN1O94822 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LTN1O94822 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LTN1O94822 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LTN1O94822 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LTN1O94822 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LTN1O94822 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LTN1O94822 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms