Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BBOX1O75936 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BBOX1O75936 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms