Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH4O75427 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH4O75427 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH4O75427 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRCH4O75427 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LRCH4O75427 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms