Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA2O75334 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA2O75334 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIA2O75334 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms