Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IGSF3O75054 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms