Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TLR5O60602 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TLR5O60602 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TLR5O60602 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TLR5O60602 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TLR5O60602 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TLR5O60602 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms