Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KIAA0556O60303 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KIAA0556O60303 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms