Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAK2O60296 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms