Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SYNGR2O43760 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms