Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF14O43557 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF14O43557 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms