Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMAD6O43541 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SMAD6O43541 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms