Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SYNJ1O43426 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SYNJ1O43426 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms