Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERI3O43414 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERI3O43414 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERI3O43414 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERI3O43414 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERI3O43414 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERI3O43414 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERI3O43414 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms