Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RASA4O43374 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RASA4O43374 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms