Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHB6O15197 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHB6O15197 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms