Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFIT3O14879 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms