Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHOX2AO14813 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms