Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BHLHE40O14503 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms