Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
O00370 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
O00370 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
O00370 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
O00370 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
O00370 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
O00370 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms