Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TULP1O00294 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TULP1O00294 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP1O00294 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP1O00294 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TULP1O00294 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TULP1O00294 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TULP1O00294 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TULP1O00294 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TULP1O00294 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms