Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DFFAO00273 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DFFAO00273 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DFFAO00273 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DFFAO00273 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DFFAO00273 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DFFAO00273 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DFFAO00273 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms