Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
J3QKU1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
J3QKU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
J3QKU1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
J3QKU1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QKU1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms