Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01387J3KSC0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms