Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms