Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms