Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP17L12C9JPN9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP17L12C9JPN9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms