Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PATL2C9JE40 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PATL2C9JE40 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms