Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BECN2A8MW95 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BECN2A8MW95 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms