Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRIQ3A6PVS8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms