Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TTLL13PA6NNM8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms