Protein–RNA interactions for Protein: A6NJR5

Putative speedy protein-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJR5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NJR5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NJR5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A6NJR5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A6NJR5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A6NJR5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A6NJR5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A6NJR5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A6NJR5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A6NJR5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A6NJR5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms