Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC69A6NI79 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC69A6NI79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms