Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PSDA5PKW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PSDA5PKW4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms