Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VPS37CA5D8V6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VPS37CA5D8V6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms