Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCHNA4D1U4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms