Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB19A4D1S5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB19A4D1S5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RAB19A4D1S5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB19A4D1S5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms