Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRD1A4D1F6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRD1A4D1F6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms