Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms