Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA8A3KMH1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms