Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPDC1A2A3K4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPDC1A2A3K4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms