Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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TCRBV5S1A1TA0A578 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCRBV5S1A1TA0A578 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCRBV5S1A1TA0A578 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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